Antes de la lista: hacemos Physioly y lo ponemos primero. Es el sesgo evidente, así que dejamos escrito el criterio: la mejor opción para un fisioterapeuta independiente o una clínica pequeña que quiere historia clínica, agenda, ejercicios y cobros funcionando esta semana, sin una cuota mensual antes de que se pague sola. Si necesitas facturación electrónica local, reservas online o FONASA, otro nombre de esta lista te servirá mejor, y decimos cuál.
Los precios de la competencia salen de sus páginas oficiales entre el 28 de septiembre y el 1 de octubre de 2026, en la moneda de cada país. Cambian. Compruébalos antes de contratar.
Los 5 mejores programas de gestión, comparados
| Programa | 1 fisio / mes | 3 fisios / mes | Recordatorios | Dónde encaja | Plan gratis o prueba |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. Physioly | Gratis · US$ 29 | US$ 95 | Enlace del paciente, lo envías tú | Cualquier país | Gratis para siempre; 7 días sin límite |
| 2. AgendaPro | $299 MXN + IVA (sin ficha clínica) · $1.200 (Premium) | $1.500 MXN + IVA (Premium) | Según plan | México, Chile, Colombia | Consultar |
| 3. Encuadrado | $1.000 MXN · 0,6 a 3 UF + IVA | Por profesional; centros a pedido | Correo y WhatsApp | Chile, México | 30 días (Chile) · 14 días (México) |
| 4. Cliniko | 39 € | 79 € (de 2 a 5) | SMS pagado por mensaje | España e Irlanda (en inglés) | 30 días, sin tarjeta |
| 5. Zanda | 19 € | 67 € | SMS pagado por mensaje | Europa (en inglés) | 14 días, sin tarjeta |
1. Physioly: el mejor para fisios independientes y clínicas que empiezan
Physioly se hizo alrededor de la historia clínica. Tiene fichas de valoración por especialidad (traumatológica, neurológica, suelo pélvico y otras), una escala de dolor que dibuja sola su gráfico de evolución, una tabla de balance articular por articulación y movimiento, y un mapa corporal donde marcas con un clic dónde duele. Los programas de ejercicios en casa, con demostraciones en 3D, vienen en todos los planes, sin suscripción aparte.
Alrededor de la ficha: agenda por profesional con clases grupales, bonos de sesiones, cobros pendientes e informes en PDF. Cada paciente tiene un enlace propio con sus citas, ejercicios y pagos, que le mandas por WhatsApp o por donde quieras.
Lo que no hace, y conviene saberlo: no tiene reserva online por el paciente, no envía SMS automáticos, no emite factura electrónica ni boletas, no gestiona mutuas ni FONASA y no trae videollamada. El recordatorio sale escrito y lo envías tú, con un toque.
Precio: gratis con 1 paciente, para siempre. US$ 29 hasta 20 pacientes, US$ 39 hasta 100 y US$ 65 sin límite. Para clínicas, US$ 95 con tres profesionales y US$ 239 hasta diez.
2. AgendaPro: el mejor si la agenda y la reserva online mandan
AgendaPro vende sobre todo a salones y centros de estética, pero tiene versión para salud. Su fuerte es la agenda con reserva online. El plan Individual cuesta $299 MXN + IVA, pero no trae ficha clínica: para eso hay que ir a Premium, desde $1.200 MXN + IVA. Los números país por país están en nuestro artículo de precios de AgendaPro.
3. Encuadrado: el mejor en Chile
Encuadrado está pensado para profesionales de la salud en Chile: integración con FONASA en todos los planes y boletas ante el SII desde el plan Profesional, que es justo lo que los demás no resuelven allí. En Chile va de 0,6 a 3 UF + IVA al mes por profesional; en México hay un plan único de $1.000 MXN. No tiene versión para Colombia.
4. Cliniko: el mejor para clínicas en España que trabajan en inglés
Cliniko cobra por tramos de profesionales: de dos a cinco pagan lo mismo, 79 €. Todas las funciones están en todos los planes, la teleconsulta incluida. Los SMS se pagan aparte y la interfaz está solo en inglés, que para muchas consultas en España es la razón para descartarlo.
5. Zanda: la entrada de pago más barata
Zanda, antes Power Diary, empieza en 19 € para un profesional, con un tope de 1.000 citas. El plan Growth suma una cuota por cada profesional extra. Los SMS se cobran por mensaje. También está solo en inglés.
Medilink no publica precios (se cotiza con demo), por eso no entra en la tabla.
Mira Physioly en acción
Abre una clínica de prueba con pacientes ya cargados. Sin registro y sin instalar nada.
Qué problemas del día a día resuelve un programa de gestión
Son problemas aburridos. Por eso se comen la semana.
La historia clínica en tres sitios. Papel para la valoración, un Word para la evolución y las mediciones en la cabeza. Un programa lo junta en una pantalla por paciente, con fecha, y lo encuentras cuando el paciente o la mutua lo piden. Escribimos sobre la historia clínica electrónica en fisioterapia.
Las ausencias. Un recordatorio el día anterior evita la mayoría. Que salga solo por SMS o que lo mandes tú desde un enlace es una diferencia real de trabajo, y conviene decidir cuál quieres antes de comparar precios.
El dinero que se olvida. La sesión fue el martes, el pago quedó para “la próxima” y la próxima fue hace tres semanas. Una lista de cobros pendientes por paciente es la función que más se subestima.
Los ejercicios en una fotocopia. El papel se pierde. Un enlace en el móvil se abre. Pregunta si los ejercicios vienen incluidos o son otra suscripción.
Automatizar la administración: el tratamiento por bonos
La fisioterapia casi nunca es una cita suelta. Son diez sesiones, dos por semana, en bono o pagadas una a una, con una revaloración hacia la sexta. Ese patrón es donde un programa te ahorra una hora a la semana o te la quita.
Lo que un buen programa hace con un tratamiento:
- Agenda la serie de una vez. Martes y jueves a las 8:00 durante cinco semanas, y mueve una sesión sin romper las demás.
- Lleva la cuenta del bono. Sesión 7 de 10, pagada; quedan dos, así que la conversación sobre renovar llega a tiempo.
- Pone la evolución a la vista. La escala de dolor y el balance articular del inicio quedan junto a los de hoy, y el gráfico se arma solo.
- Mantiene los ejercicios al día. Cuando progresas el programa, el enlace del paciente muestra el nuevo.
En Physioly, bonos, gráfico de evolución y enlace de ejercicios forman parte de la misma ficha.
Cómo elegir el programa adecuado para tu consulta
Empieza por lo que no puedes dejar de tener, no por la lista de funciones.
- Facturas con boleta o FONASA en Chile: Encuadrado.
- Tus pacientes tienen que reservar solos por internet: AgendaPro, o cualquiera de la lista menos Physioly.
- Trabajas en inglés con mutuas internacionales: Cliniko.
- Estás empezando o tienes una agenda moderada: el plan gratis de Physioly.
- Mandas muchos ejercicios para casa: suma la app de ejercicios al precio. En Physioly ya viene.
Y luego haz lo que casi nadie hace: mete una semana real en la prueba. Tu martes de verdad, tus pacientes de verdad. En cinco días sabrás si la agenda encaja con tu forma de trabajar, y eso no te lo dice ninguna tabla.
Dudas que nos llegan
¿Cuál es el mejor programa de gestión para una clínica de fisioterapia?
Depende de lo que no puedas dejar de tener. Para un fisio independiente o una clínica pequeña que empieza, Physioly tiene plan gratis permanente e incluye ejercicios. En Chile, con boletas y FONASA, Encuadrado. Si la reserva online manda, AgendaPro. Para clínicas que trabajan en inglés, Cliniko o Zanda.
¿Cuánto cuesta un programa de gestión para fisioterapia?
Para un profesional, entre gratis y unos 39 € al mes, o $299 a $1.200 MXN más IVA. Para tres profesionales, de 67 a 79 € en Europa, unos $1.500 MXN en AgendaPro Premium o US$ 95 en Physioly. Los SMS y la facturación local suelen cobrarse aparte.
¿Hay algún programa de gestión de fisioterapia gratis?
Physioly tiene un plan gratis con 1 paciente que no caduca, y los primeros 7 días sin límite. Encuadrado, Cliniko y Zanda ofrecen pruebas de 14 a 30 días.
¿Physioly envía recordatorios automáticos por SMS o WhatsApp?
No. Physioly deja el recordatorio escrito y tú lo envías por WhatsApp con un toque; además cada paciente tiene un enlace con sus citas. Si necesitas que salgan solos, Encuadrado (correo y WhatsApp), Cliniko y Zanda (SMS) los tienen; en AgendaPro depende del plan.
¿Qué programa gestiona bonos de sesiones?
Physioly lleva los bonos, los cobros pendientes y el gráfico de evolución dentro de la ficha del paciente, e incluye los ejercicios en todos los planes. Pregunta en los demás si los bonos están en el plan que vas a contratar.
Thainan Prado es desarrollador de software y fundador de Physioly, que nació en Brasil como Fisioly. Construye el sistema junto a los fisioterapeutas que lo usan a diario y escribe sobre lo que un software puede y no puede resolver en una consulta.